Важнейшая региональная особенность природы округа – наличие многолетнемерзлых горных пород,
не оттаивающих и находящихся в мерзлом состоянии, содержащих лед в течение очень долгого времени.
Выделяют четыре крупные области оледенения, совпадающие в границах с природными зонами:
Полярная и субполярная области занимают зоны тундры и лесотундры и отличаются сплошным (95 %) монолитным распространением многолетней мерзлоты. Талые грунты сохраняются только под руслами рек
и крупными озерами.
Бореальная область территориально совпадает с зоной северной тайги и характеризуется разобщенным залеганием современной и древней вечной мерзлоты.
В южной части округа современная многолетняя мерзлота встречается лишь в виде отдельных островов, но широко распространена глубоко залегающая вечная мерзлота.
На Полярном Урале насчитывается большое число снежников, а также 40 каровых и 36 присклоновых ледников площадью 15 км².
В пределах равнинной территории округа в связи
с зональным изменением климата хорошо выражены растительные зоны тундры и северной тайги.
В горах Полярного Урала наблюдается высотная поясность растительности.
В арктической тундре на побережье Карского моря растительность представлена кустистыми лишайниками, зелеными мхами и осоками.
Южнее простирается мохово-лишайниковая тундра
с мелкими кустарниками карликовой березы и ивы.
В подзоне лесотундры сочетаются еловые,
лиственнично-еловые и лиственничные редколесья.
Леса северной тайги редкостойные, низкорослые лиственнично-еловые.
Для растительного покрова Полярного Урала характерны широтно-высотная дифференциация и расположение
в зонах тундры, лесотундры и северной тайги.
Список растений, занесенных в Красную книгу ЯНАО, включает около 90 видов, среди них: